Je pense que tu as eu raison d'apprendre les bases d'Asterisk et de partir là -dessus, apprendre le fonctionnement d'AsteriskNOW ou de Freepbx sans apprendre avant Asterisk n'aurait pas été très utile.
Je ne sais pas quelles fonctionnalités de bases sont actuellement implémentées sur le système en place, mais n'oublie pas qu'il te faudra les recréer sur Asterisk, si tu enlève les fonctionnalités utilisées, les utilisateurs ne vont pas être d'accord avec tes évolutions: "avant ton truc ça marchait mieux, depuis on a que des problèmes!" :p
Si il te reste un peu de temps mais pas non plus des mois, je te conseille de te concentrer sur le fax, ca apportera une réelle valeur ajoutée pour les utilisateurs au quotidien, alors que les statistiques ou le click2call avec zimbra, ce sont aussi des morceaux assez gros mais ça ne sera certainement utilisé que par quelques personnes de temps en temps.
"Fax for Asterisk" a plutôt pour vocation de remplacer rxfax/txfax, il y'a encore du boulot à côté (conversions tiff/pdf, déplacement de fichiers, etc...), et c'est un système avec licence: la première est offerte par Digium, mais il serait dommage de te limiter à un seul envoi/réception simultané alors que tu dispose de plusieurs canaux numéris.
Pour la réception, vu que tu as des lignes numéris (important pour le taux d'erreurs, en analogique c'est autre chose), je te conseille hylafax+iaxmodem. Pour l'envoi, comme dit Reaper, Avantfax te fournira l'interface d'envoi et des tas de choses que tu ne pourrai pas développer toi-même avec le temps dont tu dispose.
Les fax numériques ne sont pas légion, il y'aura de toutes façons de la conversion de l'autre côté, ne te soucie pas de ça, la qualité n'en sera pas plus dégradée, ca reste du fax ...
Envoie les fax reçus vers la boite email d'une employée, idéalement la standardiste qui reçoit et dispatche déjà les appels téléphoniques, elle n'aura plus qu'à transférer les emails des fax vers les bonnes personnes, tout le monde appréciera de ne recevoir que les fax qui lui sont destinés, et de pouvoir les récupérer "pour toujours" dans son historique de mails, de les renvoyer par email à d'autres personnes, etc...
L'économie de papier et de toner est un bon argument aussi, pense à récupérer les stats sur le fax actuel pour montrer combien tu va faire économiser chaque année.
Pour l'envoi, je te conseille de laisser le pap2 et son fax traditionnel, les utilisateurs y sont habitués, ca ne consomme rien (c'est le scanner du fax qui travaille, et tu peux paramétrer l'impression des rapports d'envoi pour ne pas faire une page à chaque fois mais vingt résultats sur une seule page, enfin je te laisse chercher avec ton fax et voir les besoins)
A côté de ce fax traditionnel, en plus, tu peux paramétrer de l'envoi par une réception d'emails d'utilisateurs, et/ou par une interface graphique.
L'interface me semble être une bonne solution, un simple formulaire avec un champ "n° de fax" et un bouton parcourir pour aller chercher le fichier pdf, ca ne mange pas de pain (bien sûr il y'a le traitement de tout ça derrière, mais ca ne sera pas plus compliqué qu'avec les emails), mais essaye Avantfax avant...
Si la gsm gateway est une bri (branchée sur la b410p), pour les fax tu pensera à ne sélectionner en sortie que les canaux correspondants à des lignes numéris, si un fax tente de sortir par la gsm gateway ca ne fonctionnera pas.
Hylafax c'est "The world's most advanced open source fax server", et c'est vrai!