Pour comprendre .. j'ai créé dans extension_custom.conf autant de contextes que de lignes SIP ...
Pour chaque extension, je pointe son propre contexte comme ceci :

[from-09xxxxxxx]
include => ext-local
include => ext-queues
include => outrt-011-ovh_339xxxxxx
include => app-echo-test
include => app-recordings
include => app-speakextennum
include => app-speakingclock
include => app-userlogonoff
include => ext-paging
include => app-dialvm
include => app-vmmain
exten => foo,1,Noop(bar)

Donc j'ai l'impression que le problème vient du fait qu'on passe par from-internal pour le misc application... alors qu'il faudrait agir au niveau de mes contextes peut être .. je ne sais pas ...